Le 13 Septembre 1999, à la suite de l'explosion de déchets entreposés sur la Lune, celle-ci quitte son orbite terrestre emmenant la base lunaire Alpha et ses occupants à la dérive à travers l'univers. Dirigés par le commandant Koening (
Martin Landau), secondé par le docteur Helena Russel (
Barbara Bain) et le professeur Victor Bergman (
Barry Morse), les Alphans partent à la recherche d'une planète plus hospitalière.