Episode 1: On efface tout.... - LA X
Deux situations parallèles se font face. Dans la première, l'explosion a eu l'effet escompté. A bord du vol Oceanic 815 entre Sydney à Los Angeles, l'appareil subit de violentes turbulences qui cessent rapidement. Mais des choses ont changé : Desmond est là alors qu'à l'origine, il n'était pas à bord. L'avion atterrit à Los Angeles et chacun part de son côté. Dans la seconde situation, le plan a échoué. Des événements sont survenus sur l'île où les rescapés sont toujours bloqués. Kate, Sawyer et Miles tentent de sauver Juliet, prise au piège sous les décombres suite à l'explosion de la bombe. Ils semblent avoir voyagé dans le temps. Ils ne sont plus sur le site du chantier du "Cygne" mais près du bunker après son explosion. Jacob apparaît à Hurley et lui demande de conduire Sayid au Temple pour le sauver...
Episode 2: . .. et on recommence - What Kate Does
Sawyer enterre Juliet. Miles lui apprend qu'avant de mourir, elle souhaitait lui dire "Ça a marché". Kate, Jack, Hurley et Jin cherchent à rejoindre le Temple pour sauver Sayid. En route, le groupe est capturé par les Autres. Ils sont conduits au Temple où ils rencontrent Dogen, le leader mystérieux des Autres, assisté d'un autre curieux personnage, Lennon. Dogen ordonne qu'on les tue mais se ravise dès que Hurley lui crie qu'ils sont envoyés par Jacob. Dans l'autre réalité, Kate réussit à duper le marshal à l'aéroport de Los Angeles et s'enfuit en sautant dans un taxi et menaçant le chauffeur de son arme. Elle ne remarque même pas la passagère terrifiée : Claire, enceinte. Tandis que ce drame se déroule à l'extérieur de l'aéroport, à l'intérieur, une forte somme d'argent non déclarée est trouvée dans les bagages de Jin. Jack apprend que le corps de son père a été perdu. Il fait la connaissance de Locke qui a perdu sa mallette de couteaux. Le voyant dans son fauteuil roulant, Jack lui donne sa carte de visite en lui proposant une consultation médicale.
Episode 3: Cours Kate, cours - Episode #6.3
Sur l'île, les amis de Sayid sont étonnés de le voir vivant. Il est emmené par Dogen et Lennon pour un simple interrogatoire qui se révèle être une séance de torture. Les deux hommes prétendent qu'il s'agissait d'un test qu'il a «réussi». Dogen et Lennon demandent à Jack de donner une pilule à Sayid. Dogen refuse de dire ce qu'elle contient, mais lui demande de lui faire confiance. Sawyer parvient à s'échapper du Temple. Il somme Kate de ne pas chercher à le retrouver...
Episode 4: Le Remplaçant - The Substitute
Sous les traits de Locke, "l'homme en noir" commence à recruter des personnes. Il échoue avec Richard mais parvient à convaincre Sawyer de le suivre. Pour ce faire, il lui promet de lui révéler pourquoi lui et les autres passagers du vol 815 se trouvent sur l'île. Un jeune garçon étrange apparaît à "l'homme en noir" pour le rappeler à l'ordre. Arrivé dans une grotte, Sawyer apprend qu'il est un candidat. "L'homme en noir" le convainc de laisser l'île à son sort et de partir. Ilana, Ben, Sun et Lapidus décident de partir pour le Temple après avoir enterré le vrai Locke. A Los Angeles, Locke est en fauteuil roulant et vit avec Helen. Il fait la connaissance de Rose et d'Hugo et apprend à accepter son handicap. Après avoir été licencié, il est engagé comme professeur remplaçant dans un lycée où Benjamin Linus enseigne l'histoire.
Episode 5: Lighthouse
Episode 6: Sundown
Episode 7: Dr. Linus
Episode 8: Recon
Episode 9: Ab Aeterno
(A compléter) 
