Billy Ray a écrit et réalisé
Le Mystificateur, interprété par Hayden Christensen, Peter Sarsgaard, Chloë Sevigny, Hank Azaria, Steve Zahn et Rosario Dawson.
Il a coécrit le scénario de
Mission Evasion de Gregory Hoblit, avec Bruce Willis et Colin Farrell. Il avait précédemment travaillé sur
Color Of Night de Richard Rush et coécrit le scénario de
Volcano de Mick Jackson, avec Tommy Lee Jones et Anne Heche.
En 2004, il est scénariste du thriller
Suspect Zéro et poursuit sur sa lancée en écrivant l'inquiétante intrigue du
Flight Plan porté par Jodie Foster en 2005.
Billy Ray retourne à la réalisation, en 2007, avec son
Agent Double, film porté sur les tourments d'un jeune agent plongé malgré lui dans un engrenage diabolique au sein du FBI.
En 2009, il signe le scénario du Thriller
Jeux De Pouvoir de Kevin MacDonald.