Frak Whaley est le 20 juillet 1963. Il grandit à Syracuse, dans l'état de New York, et quitte sa famille à dix-huit ans pour démarrer sa carrière d'acteur. Il retrouve son frère aîné, Robert Whaley, à New York et débute sa carrière d'artiste comme chanteur dans le groupe The Niagaras, aux côtés de son frère.
S'il joue dans quelques épisodes de séries télévisées, Franf Whaley fait sa première apparition au cinéma en 1987 dans
Ironweed, avec de Jack Nicholson et Meryl Streep.
En 1989, il côtoie Burt Lancaster et Kevin Costner dans
Jusqu'Au Bout Du Reve, de Phil Alden Robinson, puis Tom Cruise dans le film d'Oliver Stone Né Un 4 Juillet. Ce film est le début d'une longue collaboration avec le réalisateur : Frank Whaley jouera dans Les Doors et Jfk en 1991 ou encore dans World Trade Center en 2006.
Au début des années 1990, l'acteur interprétera des seconds rôles dans des films comme Hoffa, de l'acteur Danny DeVito et Swing Kids, de Thomas Carter.
En 1994, il incarne l'un des rôles principaux aux côtés de Kevin Spacey dans Swimming With Sharks, de George Huang, sorti en France en 1995. La même année, il joue un petit rôle dans Pulp Fiction de Quentin Tarantino.
En 1998 il a un rôle régulier dans la série télévisée américaine "Buddy Faro". Whaley apparaît également dans plusieurs autres séries, comme Dead Zone, New York : Police Judiciaire, Ncis Enquêtes Spéciales ou Boston Justice - Saison 1.
En 2001, Whaley joue dans la comédie dramatique de Larry Clark, Bully. L'année suivante, on le voit avec Edward Norton et Anthony Hopkins dans le thriller Dragon Rouge, du réalisateur Brett Ratner.
En 2007, Frank Whaley interprète le rôle du méchant dans le film d'horreur Motel de Antal Nimrod, dans lequel il terrorise un couples de jeunes mariés joués par Kate Beckinsale et Luke Wilson.
En plus de son métier d'acteur, Frank Whaley est scénariste et réalisateur. Il a écrit et mis en scène trois longs-métrages : Joe The King, sorti en 1999 aux Etats-Unis, et dont la bande originale a été composée par son frère Robert et son groupe The Niagaras ; The Jimmy Show en 2001 et New York City Serenade en tournage en 2007.
