Natif de South Bend (Indiana), licencié "magna cum laude" de l'Université de Pennsylvanie,
Mark Waters travailla comme acteur et metteur en scène de théâtre à San Francisco avant de rejoindre l'American Film Institute.
Après avoir obtenu en 1994 une maîtrise de réalisation de l'American Film Institute,
Mark Waters écrit et réalise son premier long métrage :
The House Of Yes, interprété par Parker Posey, qui sera couronné au Festival de Sundance 1997.
Il tourne ensuite la comédie romantique
Folles De Lui, dont Freddie Prinze Jr. et Monica Potter partagent la vedette, le téléfilm
Warning : Parental Advisory et signe en 2003 le succès critique et commercial
Freaky Friday, Dans La Peau De Ma Mère, interprété par Jamie Lee Curtis et Lindsay Lohan.
En 2004, il retrouve Lindsay Lohan pour
Lolita Malgré Moi puis signe l'adaptation du livre de Marc Lévy,
Et Si C'était Vrai avec Reese Witherspoon. En 2008, il réalise
Les Chroniques De Spiderwick avec le jeune Freddie Highmore avant de produire le film de Marc Webb
500 Jours Ensemble. L'année suivante,
Mark Waters produit et met en scène la comédie romantique
Hanté Par Ses Ex avec Jennifer Garner et Matthew Mcconaughey.
En 2011, le metteur en scène dirige Jim Carrey pour la comédie familiale
M. Popper Et Ses Pingouins.
