Né en Ecosse, Michael Caton-Jones a grandi dans la ville minière de Broxburn, et a gagné Londres à l'âge de 17 ans pour y devenir écrivain. Après avoir travaillé comme machiniste dans les théâtres du West End, il entre à la National Film and Television School, où il se fait rapidement remarquer. Son premier projet,
Liebe Mutter, est élu meilleur film lors des European Film Students Awards, et son second,
The Riveter, est immédiatement acheté par la BBC. Après seulement deux ans d'études, sa réputation est telle qu'on lui propose la réalisation de
Brond, un téléfilm en trois parties pour Channel 4. Le succès de
Brond confirme son statut de jeune cinéaste des plus prometteurs.
Dès son premier long métrage,
Scandal, interprété par John Hurt, Bridget Fonda, Joanne Whalley et Sir Ian McKellen, Michael Caton-Jones est remarqué par la profession sur le plan international. Le film remporta plusieurs prix et citations, dont une à la Caméra d'Or à Cannes, des Golden Globes et des prix européens. Son second film,
Memphis Belle, suivait la périlleuse mission finale de l'équipage du bombardier de la Seconde Guerre mondiale. La distribution comprenait Eric Stoltz, Matthew Modine, Sean Astin et Harry Connick, Jr. Michael Caton-Jones se tourne ensuite vers la comédie avec
Doc Hollywood, interprété par Michael J. Fox, Bridget Fonda, Julie Warner et Woody Harrelson. En 1993, il réalise
Blessures SecrÈtes, une transposition de l'autobiographie de Tobias Wolff dans les années 50. Le film est interprété par Robert De Niro, Ellen Barkin et Leonardo DiCaprio. Deux ans plus tard, il signe la mise en scène de
Rob Roy, avec Liam Neeson dans le rôle-titre, Jessica Lange, Tim Roth et John Hurt. En souhaitant raconter le destin de l'un de ses plus grands patriotes, Caton-Jones rend hommage à la beauté de son Ecosse natale. Le film vaut à Tim Roth d'être cité à l'Oscar du meilleur second rôle.
Avec
Le Chacal, Michael Caton-Jones réalise un film d'espionnage interprété par Bruce Willis, Richard Gere, Sidney Poitier, Diane Venora et Mathilda May. Il enchaîne avec
City By The Sea, dans lequel il dirige à nouveau Robert De Niro, et Frances McDormand.
Il a depuis réalisé
Shooting Dogs, entièrement tourné au Rwanda et interprété par John Hurt et Hugh Dancy. En 2006, c'est la très attendue suite de
Basic Instinct,
Basic Instinct 2, qui voit le jour treize ans après le premier, avec toujours à l'affiche la sulfureuse Sharon Stone.